身長差15メートルの恋未知の生命体ガウナに地球を破壊されかろうじて生き残った人類は巨大な宇宙船「シドニア」で旅を続けていたが100年ぶりにガウナが現れた再び滅亡の危機に襲われた人類だったが人とガウナか...